Микроскопическое исследование урогенитального мазка у мужчин позволяет определить состав микрофлоры мочеиспускательного канала (уретры), выявить воспаление в уретре (уретрит), а также ряд специфических возбудителей, таких как трихомонады и гонококки.
Микрофлора уретры мужчин представлена главным образом эпидермальным стафилококком, некоторыми видами альфа-гемолитических стрептококков (преимущественно зеленящих), коринебактериями и Ureaplasma urealyticum в небольшом количестве. Основной микроорганизм – эпидермальный стафилококк, который продуцирует вещества, подавляющие рост патогенной флоры. Кроме того, могут выявляться микобактерии смегмы и фузобактерии, представители условно-патогенной флоры (кишечная палочка, протей, золотистый стафилококк, коринебактерии, клебсиеллы, гарднерелла, анаэробы, дрожжеподобные грибы рода Candida), которые попадают туда с кожных покровов или со слизистой прямой кишки. Верхние отделы мочевыводящих путей должны быть стерильны. К нарушению нормального состава микрофлоры уретры может привести несоблюдение правил личной гигиены, прием антибиотиков широкого спектра действия и нарушение обмена веществ.